第一部：张若昀，焦俊艳，李现主演。法医秦明、手下大宝和刑警队长林涛组成铁三角，通过尸体和痕迹破解一个个悬案。然而这些案子似乎又有同一个主谋，因为大多数被害者的臼齿都被拿掉。最后两集的时候才揭示谜底，原来秦明几年前所破的一个案子里，使女子失去了新郎（强奸案凶手，伏法）和父亲（受刺激下脑溢血而死），所以她试图嫁祸给秦明。幸有大宝坚持相信秦明，替他洗刷出狱。最后将女子绳之以法！

《法医秦明2清道夫》：铁三角的主演换了，但是剧情同样吸引人。清道夫原意是一种鱼，因喜食水族箱的残饵、污物而起到净化水质的作用，故而得名。龙番市出现凶杀案，几起案件之间似乎有联系，被害人往往有劣迹，食指被切掉，附近墙壁写上“清道夫”三个字。一时间清道夫成了正义的化身，甚至还有人模仿清道夫犯案，但法医秦明、助手陈诗羽和刑警队长绝不允许清道夫以暴制暴，清道夫必须受到法律的惩罚。相关的人物还有秦明的老师步兵教授、助教韩天峰、媒体人唐思思、诗羽男朋友刘杰明。通过深挖线索，他们逐渐发现清道夫是他们的熟人，韩天峰年幼时因家庭不和睦，父亲逼死了母亲，他杀了父亲，因而心理有负罪感，他要杀坏人来弥补这种负罪感。最终落网。